Niko Kovač proveo je na klupi Bayerna oko godinu i pol dana, a praktički cijelo vrijeme pisalo se o sukobu s pojedinim igračima.
Jedan od njih bio je Thomas Müller, Bayernov senator koji nije bio zadovoljan minutažom kod bivšeg hrvatskog izbornika. Da mu Kovačeve metode nisu najbolje sjele, potvrđuje i nedavna izjava u kojoj je nahvalio trenutačnog trenera Hansija Flicka i kritizirao Kovača.
"Ako vas žena pošalje u kupovinu s instrukcijama, onda točno znate što trebate napraviti. Ali ako vam ne da točne instrukcije, stojite ispred polica i postoji velik rizik da večera neće biti dobra", rekao je metaforički o Bayernovim trenerima ove sezone.
Nakon Kovačeva odlaska, Müller se uglavnom nalazi u udarnom sastavu Bayerna. Kovač je trenutačno na odmoru, a prema pisanju njemačkih medija, sljedeće sezone čeka ga klupa berlinske Herthe, kluba iz rodnog grada u kojem je počeo profesionalnu igračku karijeru.