Inzaghi je odlučio ipak ostati u Milanu gdje će trenirati mlađu momčad do kraja lipnja 2014.
Karijeru je počeo u Piacenzi, nakon toga je igrao u Leffeu, Veroni, Parmi, Atalanti i Juventusu da bi u Milan došao 2001. U 300 utakmica suparničku je mrežu zatresao 126 puta. S Milanom je osvojio dva naslova prvaka Italije, a dva je puta slavio i u Ligi prvaka. U dresu talijanske reprezentacije Italije, s kojom je osvojio naslov svjetskog prvaka 2006., je u 57 nastupa postigao 25 golova.
Filippo Inzaghi je trenutačno drugi najbolji strijelac svih vremena u europskim klupskim natjecanjima sa 70 golova, a više od njega, 77, ima jedino Raul. Također je najbolji strijelac Milana u međunarodnim utakmicama sa 43 zabijena gola. Vlasnik je i rekorda s najviše postignutih hat-trickova u Serie A (10), i u Ligi prvaka (tri - izjednačen je s Michaelom Owenom i Lionelom Messijem).(Hina)