Svjetski prvak iz 2007. godine jako se mučio tijekom ove sezone. Povraćao je u kacigu za vrijeme utrke u Barceloni, a jedva je vozio i na sljedeće dvije. Virus koji ga je napao nije ga puštao i Australac je odlučio sići s motora, odmoriti se i ozdraviti.
'Razočaran sam što moram pauzirati, pogotovo stoga što je Ducati sposoban za pobjeđivanje, no moram riješiti ovaj problem. Slijede mi liječničke pretrage i testovi, jer moram osigurati da se ono što se dogodilo u Barceloni više nikada ne ponovi,' izjavio je Casey Stoner početkom kolovoza.
Nakon što je propustio Brno, Indiannapolis i Misano, Stoner se ipak odlučio vratiti utrkivanju na posljednje četiri runde 2009. sezone.
Vrijeme je u posljednja dva mjeseca provodio u rodnoj Australiji i tvrdi da se osjeća puno bolje i da umor polako nestaje.
'Osjećam se puno bolje, čak mi se i apetit vratio,' tvrdi Australac.
'Znam da će se vratiti jači nego prije,' nada se Livio Suppo, šef Ducatija.
U međuvremenu je Rossi odjurio i blizu je naslovu prvaka, Lorenzo je drugi, Pedrosa treći, a Stoner i dalje drži četvrto mjesto u ukupnom poretku, iako nije vozio u ljetnom dijelu sezone.
Velika nagrada Portugala, sljedeća utrka sezone, vozi se za dva tjedna u Estorilu.